Sau năm 1975, xã Phong Thạnh Đông thuộc huyện Giá Rai, tỉnh Minh Hải.

Ngày 4 tháng 4 năm 1979, Hội đồng Chính phủ ban hành Quyết định số 142-CP[3] về việc chia xã Phong Thạnh Đông thành năm xã lấy tên là xã Phong Nam, xã Phong Tân, xã Phong Phú, xã Phong Quý và xã Phong Thạnh Đông.

Ngày 13 tháng 4 năm 1991, Ban Tổ chức Chính phủ ban hành Quyết định 183/QĐ-TCCP[4] về việc sáp nhập các xã Phong Phú, Phong Quý vào xã Phong Thạnh Đông.

Ngày 6 tháng 11 năm 1996, Quốc hội ban hành Nghị quyết[5] về việc chia tỉnh Minh Hải thành hai tỉnh là tỉnh Bạc Liêu và tỉnh Cà Mau. Khi đó, xã Phong Thạnh Đông thuộc huyện Giá Rai, tỉnh Bạc Liêu.

Ngày 25 tháng 8 năm 1999, Chính phủ ban hành Nghị định số 82/1999/NĐ-CP[6] về việc thành lập xã Phong Thạnh Đông A trên cơ sở 2.691,54 ha diện tích tự nhiên và 15.207 nhân khẩu của xã Phong Thạnh Đông.

Sau khi điều chỉnh địa giới hành chính xã Phong Thạnh Đông có 2.699 ha diện tích tự nhiên và 6.775 nhân khẩu.

Ngày 15 tháng 5 năm 2015, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 930/NQ-UBTVQH13[7][8] về việc thành lập thị xã Giá Rai và xã Phong Thạnh Đông thuộc thị xã Giá Rai.

Ngày 23 tháng 11 năm 2020, Hội đồng Nhân dân tỉnh Bạc Liêu ban hành Nghị quyết 30/NQ-HĐND[9] về việc sáp nhập ấp 14 vào ấp 12.